Niels blev gift med Jacobine Andrea Maria Bruhn den Ja, dato ukendt. Jacobine (datter af Johan Andreas Bruhn og Kirsten Caroline Olsen) blev født den 24 aug. 1825 i Garnision sogn, København; blev døbt den 21 sep. 1825 i Garnision sogn, København; og døde. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Ludovica Frederikke Emilie Krogh blev født den 27 jul. 1850 i Holmens sogn, København; blev døbt den 10 aug. 1850 i Holmens sogn, København; døde den 10 aug. 1850 i Holmens sogn, København.
2. Thorvald Emil Krogh blev født den 2 maj 1852 i Holmens sogn, København; blev døbt den 6 jun. 1852 i Holmens sogn, København; døde den 29 jun. 1852 i Holmens sogn, København.
3. Axel Herman Krogh blev født den 30 aug. 1853 i Holmens sogn, København; blev døbt den 6 sep. 1853 i Holmens sogn, København; døde den 7 sep. 1853 i Holmens sogn, København.